伊犁将军和新疆巡抚，都是朝廷高官，到底谁的权力更大？
清朝官员中，总督属于地位极高的封疆大吏。它们或者像河道总督、漕运总督那样，专门管理某项重要事务。
或者像直隶总督、两江总督那样，同时管辖几个省份或地区，掌管军政大权。负责辖区内的诉讼审判，对军民官吏，都有管辖的权责。如果发生了什么违背律法和礼仪的事情，总督也有权处置。
除了节制提督、总兵这些高级武将外，总督统辖下还有一支数量不多，却可以直接指挥的军队，被称为“督标”。
雍正年间，朝廷为了让总督更好管辖，曾规定：如果总督兼职兵部尚书，可以同时兼任都察院右都御史。这是为了让总督在节制军队的同时，更好的管辖官员。
所以，总督官阶虽然只是正二品，但因为兼任兵部尚书和右都御史，大部分情况，都属于从一品。甚至到了后来，总督还可以处理一些外交事务。虽然在大事上不能擅自决定，但具体交涉，却由总督负责。
跟总督相比，伊犁将军也不差。虽然在划分上，伊犁将军属于武职，但它却同时掌握着新疆地区的军政大权。
这是很特殊的一点。一般来说，其他地区的驻防将军，只是统辖本地八旗军，以及八旗内旗人的事务。除此之外，不能直接参与驻地内的地方政务。
伊犁将军的不同，在于清朝没有在新疆设立总督、巡抚。所以，伊犁将军成了新疆当地最高的长官。
除了要整顿军备，固守边疆，伊犁将军也要安抚民众，收缴赋税，考核提拔当地官员。虽然伊犁将军的职权、地位，在清朝二百多年的历史中，有过一些变化。
但总体上，伊犁将军在新疆，仍占有非常重要的地位。不过，伊犁将军和对军队的统辖上，有一些不同。
伊犁将军在其于乾隆二十七年设立以后，在清朝于新疆建省前，就一直是清朝在新疆当地的最高权力机构。而在光绪年间，新疆建省后，情况又为之一变，伊犁将军的职权大为缩小，总的来说由新疆巡抚管理全疆的军政和民政，但是伊犁将军做为昔日的驻防大员仍然是地位特殊，并不受新疆巡抚节制，下面就来分段讨论一下。
乾隆二十四年，清廷消灭准噶尔汗国以及大小和卓分裂势力后，那么治理新疆天山南北两路的问题就提上了日程。于是在乾隆二十五年，参赞大臣阿桂由阿克苏领兵到伊犁就任办事大臣，此伊犁设官之始。在乾隆二十七年十月，清政府颁旨正式设立伊犁将军，从其谕旨上看，伊犁将军就是统辖新疆的最高军政军政长官，文如下。
《清高宗实录·卷六百七十三》：伊犁为新疆都会，现在驻兵屯田，自应设立将军，总管事务，昨已简用明瑞，往膺其任，著授为总管伊犁等处将军，所有敕印旗牌，该部照例颁给。
关于伊犁将军的职权范围，史书记载颇多。根据清代新疆第一部官修志书《西域图志》所言，为“统辖天山南北各新疆地方、驻防官兵遣调事务”。而《钦定新疆识略》对伊犁将军的职权范围作了更为详细的说明，谓“节制南北两路，统辖外夷部落，操阅营伍，广辟屯田。应办事件印房营务处、粮饷处、驼马处及文武各员分司之”。所以，伊犁将军做为武职无疑是突出管理军政的职能的。
首先，我们看一下巡抚的权力。巡抚属于正二品的高级官员，也是一个省的最高军政长官，负责全省各方面的工作。一个省内有提督、布政使、按察使、学政和巡抚等高级官员，提督是从一品高官，管理全省的绿营军，虽然品级比巡抚高，但权力明显不如巡抚，必须受巡抚的节制。布政使负责全省的经济、民政和人事管理，属于常务副省级。按察使则负责全省的司法和治安工作，属于正三品高官。学政则负责全省的教育工作，直接隶属于朝廷。
所以说，在一个省的所有高官中，巡抚的权力更大，巡抚能够管理各方面的事务。在内陆地区，巡抚堪称是一个省的实权人物。 清朝入关以后，内陆地区继续使用行省制度，但在西北、东北地区，则没有建立行省制度。清朝在边疆地区建立了5位镇守将军，例如盛京将军、黑龙江将军、乌里雅苏台将军等等。在西北地区，准噶尔部一直与清朝长期对抗。直到清朝乾隆皇帝在位的中期，清朝才最终平定了准噶尔部。为了更好的管理西北地区，乾隆皇帝建立了伊犁将军。伊犁将军属于正一品的高官，负责管理新疆南北各地的军政事务。
伊犁将军的权力包括：节制南北两路，统辖外夷部落，操阅营伍，广辟屯田。在5位镇守将军中，伊犁将军的地位最高。在清朝历史上，从一品高官不少，但正一品高官并不多。 由于需要处理西北边疆各方面的事务，因此，历任伊犁将军都比较有能力，非常的干练。伊犁将军负责管理新疆各方面的事务，因此实际权力非常大。在清朝历史上，由于西北和东北地区没有采用行省制度，清朝对这些地区的控制力并不强。
在清朝国力强盛时期，这个问题还不算太突出。但是在两次鸦片战争以后，清朝的国力已经明显衰败。进入这个阶段，西方列强开始染指清朝夫人疆土。尤其是北方的沙俄，开始窥视清朝的东北和西北地区。在清朝后期，在沙俄的怂恿下，中亚浩罕汗国占据了新疆的大部分地区。由于兵力和控制力有限，伊犁将军根本无力阻挡。 伊犁将军之所以被称为“伊犁将军，”则是因为自己的将军府在伊犁地区。但是在清朝同治、光绪时期，伊犁将军不得不撤到了兰州。当时，由于太平天国、捻军等一系列的问题，清朝根本没有精力顾及西北地区。
关于西北地区的问题，清朝内部也有一系列的争论。李鸿章主张全力巩固海防，建立自己的海军舰队。左宗棠则认为需要巩固西北地区，因为一旦西北地区出现了问题，关中和内蒙古地区也会岌岌可危。清朝最高层结合了各方面的建议之后，决定抽调兵力收复西北地区。 平定了太平天国之后，左宗棠率领大军开始西征。经过几年的努力，终于平定了西北地区。
鉴于新疆地区没有行政区划的问题，1884年，清朝设立了新疆行省，同时出现了新疆巡抚。新疆巡抚建立以后，按照朝廷的权力划分，伊犁将军的权力大大缩小。新疆巡抚和其他省份的巡抚一样，负责全省各方面的工作，甚至负责新军的训练工作。至于伊犁将军，虽然仍是一品高官，但随着权力的缩减。伊犁将军开始出现提督和驻防将军的模式，实际权力大不如前，仅仅是品级比较高而已。新疆巡抚在乌鲁木齐，而伊犁将军在伊犁，由于不在一个城市，伊犁将军在自己的一亩三分地还算有权力。
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